Vidanjörlerin en büyük dezavantajı tank içinde köpük oluştururlar ve tankerin en az %10 en çok %35’lik hacmi köpük sebebi ile doldurulamaz yani kullanılamaz. Örneğin 9 tonluk bir vidanjöe 6-8ton arası gübre taşıyabilir.
Pompalı tankerde kullanılan Vogelsang gübre pompası tank içinde köpürme yapmaz,tankın %100’ünü gübre ile doldurmak mümkündür, dolayısı ile tek seferde daha çok gübre taşınır.
Vidanjörler -0,65 bar vakum yaratırken pompalı tanker -0,95bar vakum yaratır bu sayede vidanjör tarafında çekilemeyen katı kıvamlı gübreyi çukurdan çeker.
Vidanjör tankı çelik malzemeden yapılır, basınçlı kap olduğu için gövde sac kalınlığı kalın olmalıdır, bu da tankerin ağırlığını önemli ölçüde arttırır. Tanker boş olduğu halde bile ağır olduğu için traktörün mazot sarfiyatı yüksektir.
Pompalı tankerlerde tank basınçlı kap değildir, bu sebeple ince sacdan veya Kompazit polyester malzemeden imal edilebir. Tankın boş ağırlığı yarı yarıya hafifler, boş çeliği arazide taşımak için mazot harcanmaz.
Vidanjörler gübreyi devirdaim edemez. Tank içinde kabuklaşan gübreyi kırmak veya gübre havuzu üzerinde oluşmuş kabuklaşmayı kırmak vidanjör için mümkün değildir.
Pompalı tankerde gübre çukurunu karıştırmak mümkündür.Pompa emiş hortumu çukura daldırılır, pompa basma hattına bağlanan hortum aynı çukura gübreyi geri basar ve karıştırır.
Pompalı tanker ile 600-700m uzaktaki bir araziye veya çukura büyük çaplı sulama borusu ile gübre pompalamak mümkündür. Bu işlemi tankeri hiç doldurmadan boruya direk basmak sureti ile yapar. Benzer bir uygulamayı vidanjör ile yapmak mümkün değildir.